上世纪70年代，当时的外科主任，全国著名普外科专家张挽华教授就开始了器官移植的实验工作。80年代，陆续向英国、美国和法国等派出了多名医生进修学习，学成回国后即开始了大量的理论和实验研究工作，并于1988年成功的为两例糖尿病患者施行了胰腺移植。其后，中华外科学会常委，全国胆道学组组长周孝思教授指导了数名硕士、博士研究生继续从事器官移植的准备和研究工作，并有数篇学术论文发表在全国核心期刊上。其中，肝移植手术中门静脉转流管的研究具当时国内外先进水平。1994年，现任外科主任，中华外科学会委员，北京外科分会委员，博士生导师张同琳教授赴美国进修学习肝移植回国，正式开始肝移植的大动物研究和临床肝移植前期准备工作。同时，又有多名肝移植小组成员分赴英国、意大利、日本、澳大利亚和美国各器官移植中心学习肝移植相关技术。至2000年，各项准备工作就绪，在时任院长、外科教授侯宽永大力支持和张同琳教授主持下，2000年5月，临床肝移植工作正式开始。由于有了充分的准备和北医三院综合实力的依托，当年即完成15例，无一例手术死亡。随后，肾移植工作，胰肾联合移植工作也相继开展，各项移植工作逐步步入正规，器官移植成了我院的常规工作。在北京大学医学部主任，全国人民代表大会副委员长韩启德院士支持下，器官移植中心于2001年10月正式成立。